Libanska pustinja je jedna od najsurovijih i najneplodnijih na svetu, i može proći desetak godina bez kiše u izvesnim delovima, ali su ovi ekstremni uslovi umanjeni uticajem mediteranske klime na severu.
Leta su topla i suva, dok su zime hladnije sa nižom temperaturom uveče, a padavine su minimalne.
Klima u pustinjo je veoma oštra; dani su veoma topli dok su noći hladne. Proleće i jesen karakterišu tople i suvi peščane oluje koje mogu da traju od jednog do pet dana, donoseći temperature u priobalnim predelima do 50°C.
Od juna do oktobra je najbolje vreme za putovanje u Libiju, naročito u priobalnim predelima, kada su temperature oko podnošljivih 27°C.